《寶可夢朱紫》廢案原定劇情：冠軍竟是最終反派？
主線劇情中僅有 4 個道館，另外 4 個為可選道館。
道館館主的隊伍會隨著你擁有的徽章數量而變化。
妮莫和派帕存在，但沒有牡丹。
你依然會在故事開頭以類似方式得到故勒頓／密勒頓。
反派團隊基於行進樂隊（團隊名稱為「行進隊」）。
該地區的冠軍已經消失，然而行進隊的指揮官自稱代理冠軍。
吉尼亞是故事的核心角色，他後來揭示自己是第 4 個道館館主。
擊敗吉尼亞後，行進隊出現並險些擊敗主角，但密勒頓／故勒頓剛好在此時完成療傷，並擊敗了反派團隊。
傳說寶可夢帶著主角、妮莫、派帕和吉尼亞。
它將眾人帶到一個被人們認為只是傳說的傳奇島嶼。根據版本不同，該島嶼看起來像是 1000 萬年前的過去或未來。
島上還生活著許多故勒頓／密勒頓。
吉尼亞升級了寶可夢圖鑑，將新島嶼納入其中，並且由你為這座島嶼命名。
在傳奇島嶼上，有著類似阿羅拉的考驗（妮莫特別提到，這讓她想起很久以前阿羅拉的考驗）。
從這裡開始，真正的開放世界才展開。你可以在主島與傳奇島嶼之間自由往來。你可以選擇回到主島完成剩下的 4 個道館，也可以去做考驗。
三名角色發現了用現代文字書寫的筆記：
· 「●月●日，我被一隻傳說寶可夢帶到了一個神秘的島嶼。島上寶可夢很少，土地貧瘠。這對寶可夢來說是個嚴酷的生存之地。」
· 「▼月▼日，這裡似乎曾有某種文明存在。那個文明已經消亡，時光流逝。我啟動這台機器，是不是就能拯救寶可夢呢？」
· 「○月○日，成功了！機器啟動了！這台機器似乎能夠影響這座島嶼的環境。我要把這裡變成寶可夢的樂園。」
· 「×月×日，我在家鄉曾被稱為冠軍，但我因沉迷於研究這座島嶼，被人說是騙子，並被剝奪了冠軍頭銜。我很擔心我留在故鄉的家人。對不起。」
你可以按任意順序完成考驗，總共有 8 個考驗。每完成一個考驗，都要與一隻強大的寶可夢對戰，並且可以收服它。
思路是：每完成一個考驗，主角團中便有一人獲得重大感悟，從而獲得個人成長。
· 在第一項考驗中，妮莫意識到自己一直被學歷所束縛，但又明白按部就班的人生很無聊。她發誓要找到屬於自己的道路。
· 在第二項考驗中，派帕意識到儘管自己有才華，卻一直隨波逐流。他發誓要停止這種生活方式，並發揮自己的才華而活。
· 在第三項考驗中，吉尼亞承認自己是反派團隊的一員，但發誓要退出。
· 在第四項考驗之後，行進隊從天而降。團隊的指揮官感謝吉尼亞，因為他在吉尼亞沒有察覺的情況下，在他身上放置了發信器。
· 他們想要捕捉島上所有的傳說寶可夢。
· 你進入行進隊的飛行飛艇，擊敗了他們的四天王以及指揮官（代理冠軍）。
擊敗行進隊後，主角被傳送到一個遍布鮮花的神秘之地，在那裡他仿佛能看到自己的房子就在正中央。
主角在那所房子裡發現了一隻神秘的烏龜寶可夢。
你聽到房間後方傳來一個聲音：「……有人在嗎？」
「居然有人能走到這一步。
「恭喜你們……我一直想對走到這一步的人說這句話。
「我想創造一個寶可夢的烏托邦。
「我不在意別人如何批評我。這就是我所設想的寶可夢烏托邦！
「我夢想過、理想化過，並且我把它變成了現實！
「我把我所相信的真正寶物留在了這裡！
「你會被某種存在引導至此！
「那麼！你是否有資格獲得這個寶物呢？！
「讓我見識一下你的實力吧！」
