最初的主角並非星矢
車田正美的創作《聖鬥士星矢》動機是源自當年一份獅子座流星雨的報道，所以最初設定將主角設定為獅子座。
不過之後出於當時少年漫畫通用的成長系主角考慮，並結合「天馬行空」的含義，將其改為非黃道星座的「天馬座」。但主角的絕招「天馬流星拳」中還保存著流星雨的最初設定。
多年之後車田正美授權播放的動畫《黃金魂》中，倒是回歸本源讓獅子座成為了主角。
雙主角的設定
作品的名字曾考慮過《銀河之輪》《聖戰士》等，最後決定使用《聖鬥士星矢》，其實原本是打算名叫「聖矢」，但想到這種大氣的名字不太適合逐步成長的主角，才改用日文同音的「星矢」。
敲定主角星矢後，車田正美原本打算設計另外一名角色，以雙主角的模式敘事，但這個構想很快就被放棄。車田正美雖未言明另一名主角是誰，不過從初期的劇情來看，極大概率是獨角獸座的邪武。
角色形象和身份發生巨變
瞬的師姐、蝘蜓座青銅聖鬥士珍妮在連載版時裸穿聖衣的。認真看也可以發現，魔鈴、莎爾娜這些女性聖鬥士基本上都是如此。後發行單行本時，出於讀者年齡層的考慮，才給她們換上了皮褲。
這種改動與直接換人的比起來，只能說是小巫見大巫。冰河的師父在連載時是天蠍座米羅，由於水瓶更契合冰系招式，所以改成了水瓶座卡妙。車田正美為此還增加了一個米羅和卡妙是好友的設定，以強化冰河與米羅間的互動。
不過這導致問題的出現，卡妙是如何神不知鬼不覺地從水瓶宮跑到天秤宮去封印冰河的？因為原設中是米羅，天蠍宮緊挨著天秤宮，所以可以自由穿行。
雙子座原本就是雙生兒
雙子座的最初設定，不是雙重性格，而是雙胞胎戰士，不知為何原因成為了廢案。不過車田正美覺得雙胞胎的設定放棄了太可惜了，所以將其用到海皇篇中，誕生了加隆這一個性十足的角色。
此外，修羅這個名字本來是留給撒加的，因為車田正美感覺比較凶。
撒加的雙重性格怎麼來的
關於撒加的雙重性格，原作中並沒有太多的解釋，直到多年之後，車田正美才將這段劇情進行了補完。
2018年底，車田正美推出了聖鬥士系列的外傳《ORIGIN》，講述了死神和睡神的妹妹刻爾，在撒加和加隆出生前，將攜帶有惡靈意識的「凶星」依附在雙生子的身上，被附身的人擁有「邪惡人格」，成為「第三個雙子座」。
刻耳一直認為惡靈選擇了加隆，所以在他成年後前去引導，進一步激發了加隆的野心。不曾想惡靈最終選擇了撒加，釀成了多年之後的悲劇。
動畫與原作劇情相悖
因為動畫片的播放速度快於漫畫的更新速度，導致動畫原創劇情的事情極其常見。但動畫方過多放飛自我，也特別容易產生諸多問題。
動畫版畫蛇添足地增加了一個「水晶聖鬥士」給冰河充當師父，不曾想車田正美早有設定，所以動畫版里最後只能讓卡妙成為了師父的師父，致使冰河反覆弒師，到了冥王篇乾脆就無視水晶聖鬥士了。
教皇的設定也是如此，天知道車田正美在冥王篇里會弄出個前代白羊座史昂，東映面對曾經畫出那張被暗殺教皇年輕的臉，只能補了一個史昂影武者亞歷士的設定，名字源自白羊座的拉丁文「Aries」。
動畫與漫畫還有很多情節不同，例如天蠍座和雙魚座同滅仙女島，實際上漫畫中後者輕輕鬆鬆就干成了；山羊座被譽為「最忠誠的聖鬥士」，但漫畫中他一早就知道偽教皇的真面目，還與巨蟹座、雙魚座一起參與進來，追殺了艾俄洛斯。
青銅聖鬥士能不能升格黃金
按照漫畫最初的設定，每個聖鬥士都有自己的守護星座，上天規定你是什麼星座就是什麼星座。
不過在《聖鬥士星矢》正統續作《冥王神話ND》中，車田正美一下子就吃掉了這個設定，聲稱史昂和童虎為了聖戰從青銅升格為黃金；五青銅也被紛紛被欽定為黃金的繼承者。
其實在冥王篇中，五青銅早就穿上黃金聖衣，直接與生日對應，也不知道銀河戰爭里有什麼好爭射手座黃金聖衣的。
曙光女神的寬恕
水瓶座的絕技「Aurora execution」，當年被翻譯為「曙光女神的寬恕」。這其實是不準確的，譯者將「execution（處決）」作為「excuse（原諒）」的派生詞；而「Aurora」有著有曙光、極光、黎明或曙光女神歐若拉等多個意思，所以非常浪漫地將其翻譯為「曙光女神的寬恕」。目前一般翻譯成「極光處刑」。
將「Aurora」誤譯成曙光女神，在《足球小將》中也有體現，「北歐破壞神」萊文依靠快速移動制形成殘影，以擺脫防守的必殺技就被命名為「曙光女神之幔帳」。其實這個必殺技應該被稱為「極光幔帳」，分身一樣的殘影，仿佛極光一樣遮掩星空。
鱗衣在最初構想中是藍色的
車田正美最初打算將海鬥士的鱗衣設計成藍色，因為看起來感覺不太厲害，所以修改為金色。鱗衣的原型，主要來自希臘神話和北歐神話中，與水、海洋有關的傳說奇幻生物。
海皇波塞冬身穿的也是鱗衣，而不是宙斯選中的奧林匹斯十二神才能被允許穿著神衣。雅典娜、哈迪斯也是如此，身上穿的都不是神衣，而且聖衣和冥衣。
關於海皇篇與冥王篇
以冰河為主角的外傳《冰之國的娜塔莎》原本是作為海皇篇的序章。這一設定在動畫版中得到一定程度的實現，不過被拓展成了北歐篇。
而冥王篇在車田正美的構想中，是連載三年的恢宏篇章，並以但丁的《神曲》為模板設計了漫畫中的冥界。
可惜的是，因為《聖鬥士星矢》後期人氣下降面臨被腰斬的困境，所以只能草草完結，甚至連結局都沒有說清楚，直到後來才補了一個哈迪斯被擊敗的結局。
