《刺客教條：黑旗 同步重置》的開發人員公布了重製戰鬥系統的詳情，重點在於打造更動態、更難以預料的戰鬥。其中，核心機制是敵人將具備適應能力，會對玩家的重複操作做出反應。
在本作中，如果玩家一直使用相同的招式，敵人就會改變行為：例如，不再輕易被招架，或者會閃避那些頻繁使用的攻擊。這樣一來，玩家就必須組合運用不同的戰鬥風格，並動用全部可用的招式。終結技系統也得到進化。現在將有更多的斬殺方式，從袖劍刺殺，到將敵人撞向牆壁，或是對已倒地的對手進行追擊等等。環境要素也在戰鬥中扮演著重要角色：可以利用狹窄通道、高低差或可爆炸物體來取得優勢。
此外，遊戲還將加入新的攻擊類型，包括蓄力重擊和閃避反擊，同時武器特性也經過重製。不同類型的刀劍和火器會對戰鬥風格產生不同的影響。遊戲還將加入新的敵人類型。其中一些敵人能夠格擋普通的終結技，另一些則會發動無法招架的強力攻擊。這一切都是為了促使玩家更頻繁地改變戰術，更謹慎地對待每一場戰鬥。
