《深海迷航2》基礎基因在生物實驗室直接解鎖，擁有衝刺、控氧、提速、標記路線等實用能力。其餘基因需掃描對應海洋生物獲取，涵蓋偽裝隱身、探資源、電擊禦敵、危險預警等戰鬥生存能力，還有自動產水、自產食物、降低吃喝消耗等續航基因。
深海迷航2全基因解鎖方法
| 基因名稱 | 解鎖方法 | 效果 |
| 加速猛衝 | 生物實驗室基礎生物模組，無需掃描 | 向任意方向衝刺，規避捕食動物或者危害。 |
| 路徑標記 | 生物實驗室基礎生物模組，無需掃描 | 釋放一道資訊素軌跡，可以跟著它找到方向。 |
| 氧氣控制 | 生物實驗室基礎生物模組，無需掃描 | 靜止不動時減緩氧氣消耗。 |
| 擬態偽裝 | 掃描子彈頭 | 靜止不動時不會被捕食動物發現。 |
| 聲波迴響 | 掃描深淵巨觸 | 發射聲吶脈衝，高亮顯示附近的資源。 |
| 電流釋放 | 掃描電流海鞘 | 釋放800伏特電擊，威懾中大型捕食動物。 |
| 餌料霧化 | 掃描獵狗魷魚和劇毒海綿 | 釋放美味的霧化誘餌，分散捕食動物的注意力。 |
| 捕食感知 | 掃描啃咬鯊 | 通過特化毛細胞偵測附近的威脅。 |
| 歸航感知 | 掃描錘頭魚和放電水母 | 偵測附近有電力供應的基地。 |
| 威脅感知 | 掃描懸浮刺魚 | 通過特化毛細胞偵測附近的威脅。 |
| 過濾攝食 | 掃描四翅海鞘 | 在你的皮膚上緩慢長出可食用海藻塊。 |
| 海洋疾行 | 生物實驗室基礎生物模組，無需掃描 | 靠近水下表面或者海底時游泳速度更快。 |
| 水分瀦留 | 掃描珊瑚蟹 | 通過虎鯨般的特大腎臟從所有水源中獲取更多水分。 |
| 緩慢代謝 | 掃描啃咬鯊 | 你的微生物群落變得更加高效，食物消化速度變慢。 |
| 淡水分泌 | 掃描水蛞蝓 | 從海洋里過濾淡水，緩慢地注滿水包。 |
| 生物熒光 | 掃描潛沙矛和電流海鞘 | 在黑暗中發光 |
