在許多方面，《最後一戰：戰役進化》都是對 2001 年初代《最後一戰：戰鬥進化》的「忠實重製」。但在有一個地方，重製版做出了較大的變化：據開發者介紹，《最後一戰：戰役進化》將擁有《最後一戰》系列史上最豐富的「骷髏頭」（也就是戰役的難度詞條）。
但在啟用這些詞條之前，玩家必須先在戰役關卡中找到骷髏頭收集物，它們往往藏在關卡中難以抵達或是很容易錯過的位置。找到一個骷髏頭後，就能永久解鎖對應的詞條，下次加載戰役關卡時即可啟用。（骷髏頭也可以用於「槍林彈雨」，也就是《最後一戰》的敵潮模式。）如此設計的用意是鼓勵玩家反覆遊玩戰役：開啟某個骷髏頭詞條之後再重新挑戰一個關卡時，會得到一份不同的遊玩體驗。
光環工作室社區經理 Brian Jarrard 在一次影片圓桌採訪中表示：「我很喜歡骷髏頭為戰役帶來的可重玩價值，它們幾乎可以提供無窮無盡的變化。」
在過往作品中，骷髏頭主要用於提升《最後一戰》戰役的難度。例如「饑荒」骷髏頭會減少敵人掉落的彈藥。「接住」會讓 NPC（無論敵友）投擲更多手雷，而「失明」則會禁用螢幕上的 HUD。
也有一些不影響難度的。「我或許是你老爸」（源於士官長的老朋友喬韓森軍士長在初代中的一句嘲諷）骷髏頭會提高敵人罕見台詞的出現率（往往是很搞笑的台詞）。而如果開啟了很受玩家歡迎的「野豬獸生日派對」骷髏頭，每次爆頭野豬獸時，野豬獸身上都會噴出五彩紙屑，同時還會出現一聲孩子歡呼的音效。
系列中的上一部作品，也就是 2021 年的《最後一戰：無限》，有 12 個骷髏頭。《最後一戰 5：守護者》則有 13 個。在經過多年的更新後，《最後一戰：士官長合集》收錄的 6 個遊戲裡共有 38 種骷髏頭。而《最後一戰：戰役進化》首發時就會有「數十個」骷髏頭。
創意總監 Max Szlagor 今年 10 月在光環工作室接受 Polygon 採訪時表示：「這是迄今為止骷髏頭最多的一代。我們在積極研究，確保將玩家們喜愛的骷髏頭保留下來，同時也開發一些新的設計。」
Szlagor 不願透露《最後一戰：戰役進化》具體會有哪些骷髏頭，只是籠統地說，它們會「提供一些新的視覺效果、一些新的玩法選項。我們對此感到非常興奮。我們會在將來分享更多細節。」
不過有一些骷髏頭可以說已經得到確認了。在圓桌採訪上播放的幕後花絮影片中，我們看到了開發者在設計一個骷髏頭的畫面。螢幕上的文字提到了「岩漿地面」和「接觸時眩暈」，這表示很可能會有一個要求玩家在不接觸地面的情況下通關的詞條。
此外，光環工作室的一位工作人員通過郵件向我們證實，《最後一戰：戰役進化》還將包含一個令載具無敵的骷髏頭，讓玩家可以更方便地復刻經典的「飛天疣豬號」。（Warthog Jump，源於 2002 年一個實驗初代《最後一戰》物理引擎的影片，影片中測試者利用若干手雷將疣豬號炸到了空中。）
《最後一戰：戰役進化》執行製作人 Damon Conn 在接受 Polygon 採訪時說，「我們一直在探討可以加入什麼樣的新骷髏頭，身為製作人，我經常說的一句台詞就是『好吧，Max，你們這次又整出什麼鬼主意了？』」
不過 Conn 不願透露他否決過哪些骷髏頭點子。他笑著說：「不行不行，這個不能說。等遊戲發售了你再問我吧。」
無論《最後一戰：戰役進化》首發時會包含哪些骷髏頭，《最後一戰》老玩家們八成不會捨棄一項老傳統。《最後一戰》系列有一種很受歡迎的通關方式叫做「LASO」，也就是「傳奇難度，骷髏頭全開」 —— 不僅要選擇最高難度，還要啟用所有提升難度的骷髏頭。
在任何一部《最後一戰》中，完成 LASO 挑戰都堪稱一項壯舉，但首席遊戲設計師 Dan Gniady 在 10 月的圓桌採訪上表示，他懷疑沒有人能在《最後一戰：戰役進化》中實現這項成就：「我覺得不太可能。因為本作的骷髏頭特別多。如果有人能完成一次真正的 LASO 挑戰的話，一定要告訴我們，因為我很想看看。這肯定會非常困難。」
