據gamesradar記者反饋，《忍者外傳2：黑之章》發售後，遊戲PGP版本在手柄識別方面似乎存在問題。
媒體指出，作為一款充滿懷舊元素的動作遊戲，最合適的選擇莫過於使用原作首發平台Xbox的手柄來體驗它。然而，無論是有線連接還是無線連接方式，都無法識別Xbox手柄輸入。嘗試了禁用Steam、重啟遊戲也依然無濟於事。遊戲會一直卡在主菜單，手柄輸入完全沒有反應。Reddit也有一些玩家反映了PGP版本存在類似問題，不過似乎Steam版的遊戲沒有這個問題。
有趣的是，遊戲可以識別PS4手柄，甚至連PS4手柄的揚聲器在遊戲中也能正常工作。PS5精英手柄也能順利識別。
記者對此吐槽稱：這真的很奇怪，作為Xbox品牌的第一方作品之一，《忍者外傳2 黑之章》的Game Pass版居然無法識別自己官方認證的手柄。儘管如今大部分遊戲都選擇Xbox和PS5多平台發行，但這種情況還是讓人感覺有些荒謬。
