《薩爾達無雙封印戰記》包含薩爾達、勞魯、米涅魯、索尼婭和加儂多夫等可操作角色，每位角色擁有獨特技能與力量，可在戰鬥中自由切換並施展專屬無雙動作。
《薩爾達無雙封印戰記》可操控角色一覽
薩爾達：從未來迷途至太古時代的海拉魯公主，正尋找回到原本時代的方法。
勞魯：海拉魯王國初代國王，掌握左納烏族秘石的光之力量。
米涅魯 ：勞魯的姊姊，精通左納烏族知識的研究者，能操縱魂之力量。
索尼婭：勞魯的王后，以智慧與溫柔支撐王國，掌握時之力量。
加儂多夫：格魯德族每百年出生一位的男子，依規成為王族統治族人。
前述角色都可作為可操作角色，在戰鬥中自由切換，依各自技能展開獨特的無雙動作。
此外，本作新增「同步打擊」與「左納烏」系統：
同步打擊：與隊友攜手發動的強力連攜技，不同組合將產生不同效果，助玩家扭轉戰局。
左納烏：來自《王國之淚》的古代技術，可操作火龍之首、噴水柱等裝置，對敵人造成致命打擊或破除防禦。
