除了重新設計了一個更為精細的跑酷系統（尤其是在控制直江這個角色時），《刺客教條：暗影者》還更新了這一動作角色扮演系列的戰鬥系統。育碧所做出的這些改動，很快就引起了拉瑞安工作室一位知名負責人的注意。
拉瑞安工作室的發行總監麥可·道斯在社交平台X（原推特）上向自己的粉絲們公開稱讚了育碧在《刺客教條：暗影者》戰鬥系統方面所做的工作。「我真的很喜歡《刺客教條：暗影者》里的戰鬥，」道斯說道，「它看起來緊湊且設計精妙，還回歸了我一直想念的清晰的反擊系統，這一點很受歡迎。這是多年來最好的《刺客教條》戰鬥系統。」
自《刺客教條：起源》起，育碧就在遊戲體驗中引入了顯著的角色扮演遊戲元素，隨後在《刺客教條：奧德賽》和《刺客教條：英靈殿》中延續了這一做法，在已經對該系列的戰鬥系統進行了重大改變之後，育碧又在《刺客教條：暗影者》的戰鬥方面帶來了更多新內容。當然，一個決定性因素在於遊戲有兩位技能各異的主角：直江更多地在暗中行動，並且在面對面戰鬥中動作敏捷、反應迅速;而彌助則將一切重點放在以蠻力戰勝敵人上（儘管他也不排斥潛行階段）。
與此同時，《刺客教條：暗影者》仍不斷被拿來與《對馬戰鬼》作比較。
