從第三世代起就會發生一種現象：當一個蛋出現的時候，它也會擁有主人、ID No.和里ID No.，另外會記錄蛋的出現遊戲版本。當這個蛋被交換之後，原本應該孵出異色寶可夢的蛋有可能會孵出普通寶可夢，而原本應該孵出普通寶可夢的蛋也有可能孵出異色寶可夢。這是由於在孵化過場動畫之後，主人、ID No.和里ID No.發生了變化。
第八世代起，異色的寶可夢的蛋經過交換後，孵化的那一刻會使蛋改變原本的ID，使孵化出來的寶可夢依然是異色寶可夢。無論孵化者是不是領到蛋的訓練家。
儘管有些寶可夢看起來或其原型是哺乳動物，但是這些寶可夢也都是卵生的。
1.波克比蛋
持有者小霞，波克比的蛋也是寶可夢蛋初次在寶可夢動畫中亮相，在無印篇章中的《復活？化石寶可夢》中，小智在一個名叫大傻谷的地方發現了波克比的蛋，當然的主角團還不知道這枚寶可夢蛋中將會孵化出什麼樣的寶可夢，所以在波克比孵化出來因為第一眼看見的是小霞而主動選擇她之前，主角團的其他幾人也有對波克比進行爭搶，在波克比進化離去之前，她都是被小霞抱在懷裡行動的，順便一提讓波克比作為可以遮擋小霞裸露的腹部是製作組為了應對歐美國家的動畫審查。
波克比蛋整體為乳白色，上面數個或藍火或紅的空心三角形，也是動畫中唯一一個破殼而出的寶可夢，順便一提這個寶可夢蛋的樣式也在之後的心金魂銀的遊戲版本中得到了應用。
波克比是第二世代的寶可夢，卻在第一世代的無印篇章就登場，小霞簡直是跨版本收服第一人。
2.露力麗
持有者還是小霞，初登場她就是已經孵化出來的狀態，是小健瑪麗露的後代，在超時代篇章的對戰開拓區開篇中，超時代的主角團回到關東，遇到了小霞和小健，當時小霞被問道懷中的露力麗後就提到她是從小健那裡得到的蛋中孵化出來的，雖然她使用的技能已經強到可以摧毀火箭隊的機器，但她還是像當時的波克比一樣，對世間的一切充滿好奇。
3.伊布蛋
持有者小遙，初次登場是在超時代對戰開拓區篇章，主角團誤入一個專門幫助訓練家照顧孵化寶可夢蛋的農場，小智一行在幫助農場趕跑了試圖偷走所有寶可夢蛋的火箭隊之後，農場的撫育家為了表示感謝而贈與了主角團一枚寶可夢蛋。
伊布蛋的蛋身主色是褐色，蛋的中間有一圈呈現鋸齒狀的奶油色花紋有點像伊布的那圈白色圍脖。
小遙帶著伊布一路成長，後來在DP篇章中得知這隻伊布進化成了冰精靈。
4.火球鼠蛋
持有者小光，初次登場時在寶可夢動畫珍珠鑽石版本中，在前往睡蓮鎮的旅行中，主角團一行救援了一隻被夾在建築物縫隙中的瑪麗露，瑪麗露的訓練家是一名來自城都地區的訓練家琴音，主角團一行從這位少女的口中知道了以寶可夢蛋作為獎勵的對戰大會，最後對戰贏家小光獲得了作為對戰大會獎勵的火球鼠蛋。
火球鼠的蛋絕大部分都是灰綠色，只有地步有著白色的部分，灰綠色的部分還有數個紅色橢圓的花紋和火球鼠背部的可以噴出火焰的紅色小孔類似。
小光孵化出火球鼠後也沒有停止培養，在BW篇章中得知它已經進化成了火岩鼠。
5.阿羅拉六尾蛋
持有者莉莉艾，阿羅拉六尾蛋是被人從拉納基拉山發現，在寶可夢日月的動畫中，作為寶可夢學校校長的成也大木，讓同學們從小智從大木博士拿來的蛋中選擇一顆拿回去照顧，莉莉艾以花紋很可愛為主觀意見，從而讓大家決定選擇了阿羅拉六尾蛋，最後也由瑪奧提議讓莉莉艾從照顧寶可夢但開始慢慢學會和寶可夢相處，之後孵化出來的阿羅拉六尾也順勢成了莉莉艾的第一隻寶可夢。
阿羅拉六尾蛋的蛋身為雪白色，上面有著五瓣花一般的花紋，正中心的一枚是淡綠色，其他都是淺藍色，雖然特徵其實並不明顯，但確實是有著很可愛的花紋呢。
莉莉艾雖然手持冰之石，但是直到旅途完結，這隻六尾仍然沒有進化。
