據Nintendo Everything消息，《薩爾達傳說：時之笛》重製版開發團隊對外確認，本作並未沿用原版的代碼和資源，所有內容都選擇從零重新製作。
程序總監Hiroki Taguchi在訪談中解釋，原版距今已有28年，團隊才定下這套重製方案。不同於移植舊代碼再修補的常規方式，開發組逐一實現功能，反覆對照原版效果進行疊代打磨。
導演HokWai Ng表示，林克的動作保留原作核心特質，團隊著重把控獨特的操作反饋。同時設計做出適配，讓習慣《曠野之息》等新作的玩家遊玩時不會產生割裂感。
本次改動里關注度最高的是取消自動跳躍。原版林克僅能在特定區域觸發跳躍，重製版改為獨立跳躍按鍵，隨時起跳，適配現代玩家的操作習慣。
系列製作人青沼英二談到，自由跳躍豐富了探索方式，但也增加開發負擔。取消原有限制後，團隊需要預判玩家各類行為，同步調整場景，初期內部對此改動也曾有過猶豫。
美術總監Aya Shida補充，幼年林克與成年林克跳躍距離並不相同，地形間隙都要反覆校準，兼顧兩者的跳躍尺度，關卡平衡工作存在不小挑戰。
