在《寶可夢Pokopia》中，聯機玩法分為本地面聯、在線訪客和雲島聯機三種模式。所有聯機的核心入口均為寶可夢中心的聯機機器，玩家需要先推進主線劇情解鎖寶可夢中心，才能開啟聯機功能。
寶可夢Pokopia聯機方法
一、解鎖聯機
推進主線劇情，建造出第一個寶可夢中心。
修復中心內的聯機機器後即可使用聯機功能。
必要條件：所有玩家需持有遊戲本體;在線聯機需要NSO會員，本地面聯則不需要。
二、三種聯機方式
1. 本地面聯（同屋/同Wi-Fi，無需NSO）
房主操作：前往寶可夢中心→使用聯機機器→選擇本地聯機→創建房間。
好友操作：同界面選擇本地聯機→加入房間→搜索並加入。
遊客權限：可探索世界、協助戰鬥，但不能修改房主世界的建造。
2. 在線訪客（去好友劇情島，需NSO）
房主操作：聯機機器→選擇在線聯機→開放世界→設置密碼或設為好友可見。
好友操作：聯機機器→選擇在線聯機→搜索好友或輸入密碼→加入。
限制：訪客僅能在調色鎮（Palette Town） 協助建造，其他區域不可修改。
3. 雲島聯機（獨立雲世界，房主不在線也能玩，需NSO）
房主操作：聯機機器→選擇雲島→創建雲島→設置名稱和密碼，系統會生成一個9位ID。
好友操作：聯機機器→選擇雲島→輸入9位ID和密碼→加入。
特點：
這是一個獨立存檔的世界，所有加入的玩家可共同建造。
雲島上的物品和進度無法帶回玩家的主世界，但配方是互通的。
