任天堂已經確認，《薩爾達：時之笛 重製版》由旗下EPD第三製作組負責開發。該團隊此前曾參與製作《薩爾達傳說：曠野之息》和《薩爾達傳說：王國之淚》。這一消息來自任天堂於11月2日發布的《開發者訪談》第24期前兩章，距離遊戲正式發售僅剩三天。
本作由HokWai Ng擔任導演，這也是他首次主導任天堂遊戲項目。Ng於2006年以策劃人員的身份加入任天堂，此後參與了《王國之淚》的遊戲設計工作。《薩爾達傳說》系列製作人青沼英二與《曠野之息》《王國之淚》導演藤林秀麿共同擔任本作製作人。
美術總監Aya Shida此前參與過《皮克敏3》《瑪利歐賽車8豪華版》和《王國之淚》的開發。程序總監Hiroki Taguchi則曾參與《曠野之息》的製作。音樂負責人兼音效總監之一的Masato Ohashi，此前參與過《集合啦！動物森友會》和《斯普拉遁3》擴展季票的開發。
青沼英二表示，決定重新製作這款遊戲，部分原因也與開發團隊的人員構成有關。他指出，目前與自己合作的許多開發者，只經歷過近年來的《薩爾達傳說》作品，因此未必能夠真正理解1998年原版《時之笛》對整個系列意味著什麼。在他看來，從頭開始重製遊戲，能夠讓年輕開發者深入了解原作的結構和開發方式，並將這些經驗運用到未來的《薩爾達傳說》作品中。此外，系列即將迎來40周年，也是推動此次重製的原因之一。
青沼英二表示，他幾乎給予開發團隊充分的自主權，允許他們根據需要修改遊戲中的任何內容。不過，最終遊戲的改動幅度之小，還是讓他感到意外。
他認為，《時之笛》的魅力在於其精心安排的冒險節奏：遊戲會循序漸進地提升玩家的操作能力，同時逐步引導玩家理解故事。任天堂希望，讓已經習慣於在《曠野之息》中從一開始就自由選擇探索路線的玩家，也能體驗這種更加線性、循序漸進的遊戲結構。
在接受法新社採訪時，青沼英二還特別提到了年輕開發者的貢獻。其中一些成員此前甚至從未玩過原版《時之笛》，但他們從現代玩家的角度出發，幫助團隊決定如何讓這款經典作品適應當下的遊戲環境。
任天堂表示，本次訪談的前兩章主要介紹了Switch2重製版如何繼承N64原版的設計理念、開發團隊如何努力保留原作體驗，以及重製版的美術方向。第二章的標題為《畫面可以改變，但遊戲體驗不會改變》。第三章和第四章預計將於11月3日公布。
此次訪談也終於解開了外界數月以來關於遊戲開發團隊的猜測。今年9月，挪威零售商Elkjop曾在商品頁面上將Monolith Soft列為本作開發商，讓不少人認為這家曾協助EPD製作近年來多部《薩爾達傳說》作品的工作室將負責此次重製。
另一些玩家則猜測，開發工作可能交給Grezzo。這家工作室曾負責2011年3DS版《時之笛3D》，之後還開發了《姆吉拉的假面3D》、2019年推出的《薩爾達傳說：織夢島》重製版，以及2024年的《智慧的再現》。
原版《薩爾達傳說：時之笛》由任天堂EAD開發，於1998年登陸Nintendo 64，是系列首款採用3D畫面的作品。此次Switch2版是該作第二次推出完整重製版，此前一次是登陸Nintendo 3DS的《時之笛3D》。
