相較於3，《忍者外傳4》在吸取了前作經驗教訓的基礎上，通過引入更主動、更具深度的戰鬥系統，增加角色和武器多樣性，以及大幅優化敵人和關卡設計，成功地實現了系列的現代化革新。
忍者外傳4和3區別介紹
戰鬥系統的革新
戰鬥系統的變革是兩代作品最核心的區別。
從「斷骨」到「資源循環」-《忍者外傳3》及其加強版《刀鋒邊緣》引入了「斷骨」系統，
其核心紅光斷骨更偏向被動等待敵人出現特定動作後反擊，在一定程度上放緩了遊戲節奏。
而在《忍者外傳4》中，取而代之的是一套鼓勵主動進攻的資源管理系統，通過「強化攻擊」主動製造斷肢和處決機會，
形成「消耗資源→擊殺敵人→回復資源」的流暢戰鬥循環，更回歸系列「在進攻中活下去」的核心理念。
操作更現代，但鎖定有待改進本作引入了精準閃避、精準格擋和拼刀等在現代動作遊戲中更常見的機制，降低了新玩家的上手門檻。
不過，本作的軟鎖定索敵系統存在一些問題，在高難度下可能會影響戰鬥體驗。
角色與關卡體驗
雙主角與多樣化武器-《忍者外傳3》你只能操作隼龍一人，且初版僅有一把武器。
《忍者外傳4》則加入了新主角八雲，形成雙主角設定。
兩位角色擁有不同的武器和戰鬥模組，例如隼龍的龍劍和八雲可切換的多種武器，豐富了戰鬥多樣性。
敵人與BOSS設計在敵人設計上，《忍者外傳4》被認為是系列最佳。雜兵種類更豐富，行為模式也更清晰。
更重要的是，飽受詬病的BOSS戰得到了巨大改善，互動感強的人形BOSS增多，整體設計可圈可點。
更具探索性的關卡-相較於前作較為線性的流程，《忍者外傳4》的關卡中出現了更多的岔路和隱藏戰鬥，
並且加入了類似白金工作室風格的軌道跑酷環節，鼓勵玩家探索並重複遊玩以達成更高的關卡評價。
