動漫火影忍者中，曉組織可以說是人氣非常高的反派組織，而且絲毫不弱於主角團，不過和後來的曉組織比起來，最開始的曉組織也是頗具規模的民間組織，但是在彌彥死後，長門成為了曉組織的首領，在帶土的影響之下，長門對曉組織做出了五點改變。
精兵
在最開始的時候，曉組織的成員可以說是非常多了，甚至可以說是有上百號人，但是在長門接任曉組織的首領之後，開始做出精兵政策，不過這可不僅僅是簡單的裁員，而是去除掉那些弱小的忍者，換來的都是來自各國的S級通緝犯，雖然人數減少了，但是在作戰能力上來講，曉組織的戰鬥力增強了不知道有多少倍。
兩人一組
在這樣的曉組織成立之後，為了方便行動，長門讓這些人兩兩分組，第一點自然是為了行動的效率，第二點也是擔心人數過多的話，難免會引起一些人的注意力，畢竟是那麼多S級別的叛忍，所以還是小心一點好，第三點也是為了避免組織內部出現自殘的情況，畢竟大家都是S級的叛忍，難免會出現一些衝突，就比如說角都，在此之前已經有很多同伴慘遭他的毒手了。
政策簡化
對於曉組織的成員，只要不背叛組織的話，不管做什麼都不會有人管，成員們只要不暴露曉組織的秘密，其餘的事情願意做什麼都可以，不過曉組織的成員畢竟都是一些S級別的叛忍，對於這些規則也會自覺去執行，而且只要能夠完成任務，不管做什麼都可以，就算殺掉自己的同伴也沒有什麼事情，大不了就換一個新的同伴就可以了。
招募新人
曉組織最開始其實是相應民間號召的組織，是可以自願加入的，但是在長門執掌曉組織之後，就變成了強制加入，比如說被小南找來的蠍，還有角都，飛段這些人都可以說是強制性拉到曉組織的，不過還好曉組織沒有什麼約束力，再加上首領的實力也很強，有這樣的一個組織作為靠山，對於S級叛忍來說也未嘗不是一件好事。
目的
曉組織的目的其實一直都沒有變，都是為忍者世界帶來和平，但是長門和彌彥卻是兩種方式，長門在帶土的引導之下收集尾獸，是希望讓世界先感受痛楚，然後再去以神的身份為忍者世界帶來和平，而彌彥的想法就和鳴人是差不多的，兩個人的方式雖然目的一樣，但卻是走了兩個不同的極端，不過會變成這樣子，也和帶土的誘導有關。
所以整體來看，曉組織改變的不是自己的初衷，而是實現夢想的方式，畢竟在長門和彌彥的想法是完全不同的，可是兩個人想要做的都是給忍者世界帶來和平，不過這個過程中如果沒有帶土的話，或許長門也不會如此激進吧。
雖然長門在執掌曉組織之後改變了彌彥的初衷，但是長門還是希望世界能夠擁有和平的，只不過是他用錯了方法，走錯了道路罷了。
