Metacritic於11月5日開放《薩爾達傳說：時之笛》重製版玩家評分後，該作目前以9.7分成為M站史上用戶評分最高的遊戲。儘管遭遇惡意刷負評，仍未影響其登頂。
M站最新用戶評分排名顯示：《薩爾達傳說：時之笛》重製版以9.7分居首;《光與影：33號遠征隊》以9.4分位列第二;《沉默之丘2》（2001）、《巫師3：狂獵—血與酒》、《惡靈古堡：安魂曲》和《斯普拉遁塗擊隊》均以9.3分並列第三。
媒體評分方面，《時之笛》重製版在M站獲得96分，低於N64原版的99分。玩家評價中，不少人認為該作是掌上遊戲機平台畫質最出色的遊戲之一，但也對海拉魯開放區域出現的畫面閃爍問題表示遺憾。部分玩家認可本作操作方式更加現代、迷宮探索體驗不再令人煩躁等改進;也有玩家指出，未加入大師挑戰是一大缺憾。
此外，該作遭遇了一些惡意0分評價，部分用戶提出毫無依據的指控，例如稱遊戲使用生成式AI，或認為其過於像原版。目前至少有30條同類評價已被平台方刪除。
