動畫中存在一個奇怪的設定，那就是同一隻寶可夢如果進化，它的性格有概率改變，上一秒和你嘻嘻哈哈的寶可夢，如果進化了很可能對你變得愛答不理，典型例子就是小豪的閃焰王牌，淚眼蜥。
小智隊伍中存在相當多這種例子，一起來看看。
1小火龍——火恐龍——噴火龍
小智的小火龍是被一個叫大佑的訓練家拋棄的，當他差點被凍死的情況下被小智救了，於是小火龍相當尊重小智，甚至在寶可夢聊天之中它對小智使用的還是敬語，前期它也是相當的給力，幫助小智打贏許多對戰，可能是經驗吃的太多了，等級一下飆升，小火龍它進化了，變成火恐龍的它就好像進入了人類的青春期，變得叛逆起來，完全不聽從小智的指令。
沒過幾集它為了和化石翼龍打架進化成噴火龍長出了翅膀，變成噴火龍的它仍舊看不起小智，它覺得小智這個菜鳥不配指揮它，小智遇到這種情況也很無奈，一般來說也儘量不讓噴火龍出戰，問題是聯盟賽上因為火箭隊介入，小智的比比鳥體力耗盡，他只能讓噴火龍出戰，面對阿宏的小火龍，小智的噴火龍沒有戰意輸掉了比賽，小智最後也沒有怨恨噴火龍，他承認是自己實力不足。
直到橘子群島的一集噴火龍因為自大被快泳蛙擊敗，眼看生命垂危，是小智熬夜幫助其取暖讓其轉危為安，噴火龍這才開始聽小智的話，成為小智的得力幹將。
之後老噴跟隨小智南征北戰，立下汗馬功勞，還擊敗過傳說寶可夢急凍鳥。
老噴的性格從原本的有些盲目聽從變成叛逆，最終變成了一個有擔當勇敢的王牌。
2火球鼠——火岩鼠
小智的火球鼠在城都地區的時候表現很一般，因為它的性格太懦弱了，對戰中多以躲避為主，而不會去發起反擊，只有到了絕境時刻它才會釋放出鬥志的火焰，而且它在平時也非常膽小，常常被其他寶可夢欺負。
直到DP篇章它進化成了火岩鼠，進化後的火岩鼠明顯勇敢多了，變得開始積極作戰，一下就能用噴火秒殺火箭隊，在後來的聯盟賽中也有登場，和尚志的太古盔甲打成平手。
3小火猴——猛火猴——烈焰猴
嚴格意義上小火猴的轉變是換了訓練家就開始了，在真嗣的嚴格訓練下，小火猴顯得唯唯諾諾甚至有點自卑，但是到小智這邊，小火猴的天性就被釋放出來，它逐漸變得開朗樂觀，進化後它更加自信，在各種對戰中都展現了超強的戰鬥力，三段後的烈焰猴它更是遊刃有餘，哪怕是對著舊主人真嗣和電擊魔獸，它都能自信的向他們打招呼，可以說它真的已經蛻變了。
在旅途中烈焰猴甚至去挑戰傳說寶可夢火焰鳥，雖然沒打贏。
4嗡蝠——音波龍
小智的嗡蝠是從摔跤鷹撿來的蛋里孵化的，剛出生的它相當稚嫩，怕生的它下意識就會哭出來，還放出了令人難受的超聲波，在眾人的照顧下它很快成長起來，從一開始笨拙的飛行到後面能夠熟練的飛翔，不過它此時還是比較情緒化的，在寶可夢空中接力賽中輸了它會很沮喪，在XY103集也會為了朋友花葉蒂一致排外。
在XY109集為了保護摔跤鷹，它進化成了音波龍，擊退了閃電鳥，這是它本劇最為高光的時刻，進化後的它性格就成熟很多，但是不變的是它和摔跤鷹的友情。
5蟲寶包——寶包繭——保姆蟲
蟲寶包一開始相當好強警惕，面對示好的小智它也毫不留情的會去攻擊他，不過小智在森林中與其相處，成功打消了它的警惕心，最終在小智救了它一回後它喜歡上了小智。
但是如此有個性的蟲寶包進化後就變樣了，它變成了一個富有愛心的男媽媽，剛進化就給夥伴們各做了一件葉子衣服，不過可能因為審美過於直男，讓身為女孩子的藤藤蛇和電飛鼠難以接受。
電擊對決！枯葉道館、忍術對決！呱頭蛙對龜足巨鎧!!都強調了進化的不可逆性。動畫中比較淡化經驗值的存在，比如復活!? 化石寶可夢！中小智的火恐龍為了和挑釁自己的化石翼龍決鬥而強行進化成為噴火龍。有時也會出現意外導致進化的情況，在武士少年的挑戰！中大針蜂攻擊小智的鐵甲蛹時擊破了它的蛹，使它進化成為巴大蝶。另外，有時寶可夢也會自主選擇不進化，作為它信念的表達，如妙娃種子的不思議花園中小智的妙蛙種子。
在不可思議的生物 寶可夢！中提及，進化經常是由與人類的強韌牽絆或是寶可夢自己想要變得強大這一熱切想法而開始的。
所以動畫中寶可夢進化與否真的要謹慎。
