故事要回到13號地區的戰鬥中，當時，一群護士也被派往這個地區去治療士兵，可是，沒想到感染的士兵裡面，一部分士兵並沒有變異就被送到了這個地方，可當他們被送往救護站時，他們終究還是變異了，發瘋的他們開始破壞整個13號地區的情況，聯合部隊的高層也收到了這件事情，很快派遣了部隊前往這個地方進行鎮壓。
可遺憾的是鎮壓行動失敗了，理由無他，就是因為這裡出現了一種新型感染體，這種感染體可以隱身，使得身體呈現出透明狀，士兵們壓根沒有注意到這些感染體的可怕，很快，鎮壓行動便在這樣的感染體面前失敗了，而這些感染體到底是怎麼來的呢？原來，之前被派遣到這裡的那群護士，也遭到了感染士兵的抓傷。
面對病毒的侵襲，他們利用了自己作為醫護人員的知識，開始給自己體內注射一些藥物，可是，誰曾想，原本以為這些藥物能夠治療自己，卻沒想到這種藥物卻反過來進一步提升了病毒的殺傷效果，就在這個病毒和藥物的作用下，這些感染的護士出現了新的變異，也就是我們熟悉的瘋狂寶貝的由來。
故事來到了13號地區淪陷一段時間過後，潛伏者再次派遣了一支部隊前往這個地區，準備採取更加強烈的鎮壓力度，在他們的鎮壓下，取得了一定的效果，在這個地方，潛伏者的僱傭兵部門成功俘獲了一批瘋狂寶貝，看著他們感染的情況後，潛伏者決定將其帶回自己的研究所裡面進行進一步的研究，目的就是想找出感染的原因。
這些瘋狂寶貝雖然已經徹底轉變成了生化感染體，但並沒有完全變異，還保留了屬於自己的個人意識，潛伏者將他們帶回到研究所研究過程中，卻因為生化戰爭的局勢愈發嚴重，讓研究所無暇顧及這些瘋狂寶貝，而這些瘋狂寶貝長期被囚禁在這個地方，再加上周圍環境的壓力，由於保留了部分個人意識，使得他們開始出現性格方面的扭曲。
最終，他們在研究所爆發了，一起事故讓研究所關押他們的地方出現了鬆散，這些變異暴走的瘋狂寶貝得到了進一步的進化，成了變異寶貝，並且利用這次機會，這些變異寶貝開始在研究所瘋狂感染和屠戮研究員，最終，整個研究所徹底淪陷了，而變異寶貝也從研究所裡面掙脫束縛逃了出去，故事到這裡就徹底結束了。
