《沉默之丘f》毫無疑問不是傳統的《沉默之丘》系列作品，除了將舞台搬到日本外，玩家們討論度最高的就是《沉默之丘f》的戰鬥系統。製作人岡本基曾經表示《沉默之丘f》將有「更具挑戰性的動作玩法」，很多玩家懷疑《沉默之丘f》會採用「魂類」遊戲的設計。對此岡本基解釋稱《沉默之丘f》不是魂類遊戲。
在科隆遊戲展上，岡本基解釋稱《沉默之丘f》並不是一款魂類遊戲。他表示最近在網路上頻繁看到給《沉默之丘f》掛上魂類遊戲標籤的說法，但是他認為這種歸類有失偏頗。如今的玩家看到體力條、閃避機制就會下意識的認為「這是魂類遊戲」。但是這些元素在《沉默之丘》系列早已存在，像是《沉默之丘3》就已經有體力條，而《沉默之丘4》就可以蓄力攻擊。所以他必須重申《沉默之丘f》不是魂類遊戲。
在《沉默之丘f》中女主角深水雛子在戰鬥上可以使用輕重攻擊以及蓄力攻擊，同時可以進行精準閃避與反擊。雖然官方曾經表示蓄力重擊出招緩慢是因為深水雛子是一個「力量有限的普通少女」，然而閃避反擊機制卻引發玩家們的質疑，尤其是科樂美宣布《沉默之丘f》是「為迎合如今年輕玩家對挑戰性動作遊戲的偏好」。戰鬥機制的變化與遊戲設定的大改，《沉默之丘f》或許會成為《沉默之丘》系列的新起點抑或過於大膽的嘗試。
