《文明帝國 VI》的新機制使用了「Ages」的時代取代了前作中的「Era」時代，不再是每個文明按照不同節奏更替時代，而是所有人共同升級。
目前遊戲中包含 3 個時代：古代、探索時代和現代。在這些時代後遊戲就會結束。根據一位 Reddit 論壇用戶數據挖掘發現，第四個時代：原子時代。而挖掘出來的一些新的領導人包括「黑鬍子」Edward Teach、Sayyida al Hurra 以及 Whina Cooper。一些新的文明則包括冰島、毛利，以及「海盜共和國」（歷史上真實存在的，由包括黑鬍子在內的一眾著名海盜建立，並非真正的國家）。
開發者此前也曾透露過將推出更多時代，另一方面遊戲目前在 Steam 上仍然「褒貶不一」，而開發者曾表示將繼續努力改進，因此這些內容應該正在積極開發中。目前遊戲結束正在冷戰時代前夕，「原子時代」預計將從冷戰移植延續至現代，甚至到近未來，包括太空旅行等。
