iPhone 16e 現在是蘋果唯一一款配備單後置攝像頭的 iPhone，雖然它擁有與 iPhone 16 相同的 4800 萬像素廣角鏡頭，但缺少 iPhone 16 相機的幾項功能。
憑藉 4800 萬像素 Fusion 鏡頭，iPhone 16e 相機擁有標準的 1 倍視野和 2 倍變焦選項。它沒有長焦鏡頭，因此沒有其他變焦選項，也沒有用於微距圖像的超廣角相機。由於只有一個鏡頭，因此也沒有空間圖像和影片錄製選項。
它提供相同的原彩閃光燈、Photonic Engine、Deep Fusion和智能 HDR 5 選項，但不支持具有焦點控制或最新攝影風格的下一代人像模式。拍攝人像照片時，可以選擇隨後調整焦點，但沒有像 iPhone 16 那樣點擊更改照片主題的選項。
它還缺少幾個影片錄製功能，包括電影模式和動作模式，但支持新的音頻混合功能。
至於前置攝像頭，iPhone 16 和 16e 具有相同的功能集，但不支持電影模式、攝影風格和人像拍攝的深度控制。
