開場就是等離子團老大魁奇思的自白，他為了得到傳說中的寶可夢隱忍多年，甚至培養了一個能夠聽懂寶可夢語言的人，沒錯那就是N。
在七賢人的注視下，魁奇思將N推上等離子團王的位置，魁奇思讓N去追求自己純粹的「理想」，但是自己則帶人謀劃著更邪惡的計劃。
在合眾地區的一座城市中，我們的黑白遊戲女主透子登場，雖然她的寶可夢暖暖豬還沒有進化，但是暖暖豬和她的關係已經非常親密。
透子注意到城市的廣場上聚集著許多人，為了一探究竟她也過去湊了個熱鬧，沒想到好友黑連也在，兩人來不及對話，廣場中心的魁奇思就開始了演講。
魁奇思說了一堆諸如「寶可夢和人是平等關係，因此不能收服他們」的歪理，接著勸導人們解放寶可夢，遊戲中真的有人被等離子團的言論洗腦從而放生寶可夢，但是主角並沒有這麼做。
能夠聽懂寶可夢心聲的N在和主角寶可夢交流後大受震驚，因為主角的寶可夢壓根不想回歸自然而是希望和主角在一起，這和N從小接受的理念有所不同。
和主角的相遇並沒有改變N的初衷，因為有著純真的理想，N得到了傳說寶可夢捷克羅姆的認可，而這件事正是魁奇思計劃中的一環，魁奇思在寶可夢聯盟地下製造了一座巨大的城堡，這座城堡是合眾地區構造新世界的一個象徵，而城堡內也發生著新舊交替的對戰，N帶著捷克羅姆和聯盟冠軍阿戴克對戰，N不講武德使用一級神，阿戴克的火神蛾哪裡是對手？三兩下就被干碎了。
雖然N不曾打過道館，但是他還是坐上了冠軍的寶座，眼看合眾地區就要落入魁奇思之手，主角透子趕到，拿出了真實的光明石，魁奇思自以為她是螳臂當車，放任透子去挑戰N，本集到這裡就結束了。
編劇還是一如既往的仁慈，沒拍出後面N的捷克羅姆被流氓鱷摁在地上暴揍的場景，由於本集卡在主角和N對戰結尾，那麼許多沒玩過遊戲的玩家可能覺得N是大反派，魁奇思只是個神神叨叨的小角色，其實魁奇思才是幕後主使，N只是個棋子罷了，當看到N被主角打敗，魁奇思會親自上場，他的實力比N還要強，等離子團真實目的是統治人類，解放寶可夢只是個幌子罷了。
