儘管《潛龍諜影3：重製版》存在諸多改動，但科樂美正通過多種方式努力保留原作的魅力。這體現在遊戲中加入經典濾鏡、沿用經典操作模式，同時堅持使用與原作相同的劇本。此外，遊戲還新增了「秘密劇場」，為部分過場動畫提供搞笑版結局，增添了幽默元素。
科樂美在發布會的擴展展示中首次透露，遊戲保留了與原作相同的畫面風格。開發者證實，新版本中加入了全新的「秘密劇場」影片，但為何不將舊版影片也進行翻新呢?在最新一期《潛龍諜影——製作熱線》中，創意製作人透露，這是過場動畫監督的想法。
「負責原作影片的核心人員目前仍在團隊中，且實際上他現在擔任《潛龍諜影3：重製版》的過場動畫監督。他認為，用原作畫面呈現這些搞笑片段效果更佳。他提出，如果要使用新畫面，就應該重新製作影片——哪怕只能做出一小部分。因此，我們保留了現有場景，並利用新畫面製作了一些新內容。」
玩家可通過擊敗敵人收集「秘密劇場」影片作為收藏品，但目前尚不清楚新增內容的具體數量。
《潛龍諜影3：重製版》將於8月28日全球同步登陸Xbox Series X/S、PS5及PC平台。
